香港公司强积金扣款通常是通过以下步骤进行的：

1. 公司提交强积金申请：首先，公司需要向香港政府提交强积金申请，包括公司名称、地址、员工人数、工资总额等信息。

2. 审核和批准：香港政府会对提交的申请进行审核，如果符合要求，就会批准公司加入强积金计划。

3. 扣款账户设置：一旦公司被批准加入强积金计划，就需要设置扣款账户，通常是通过银行账户进行扣款。

4. 定期扣款：强积金计划会按照员工工资的百分比进行扣款，通常每月或每季度扣款一次。扣款的金额和时间表会在员工工资单上明确说明，并提前通知员工。

5. 资金分配：员工缴纳的强积金将被分配到不同的账户和基金中，包括退休金账户、疾病应急基金、基金投资等。这些账户将根据强积金的政策和法规进行管理和投资。

总的来说，香港公司强积金的扣款方式非常透明和规范。公司需要按照规定提交申请，设置扣款账户，并提前告知员工扣款的时间和金额。员工也可以通过自己的强积金账户查看资金分配情况。在香港，强积金是一个非常健全和完善的计划，旨在保障员工的退休生活，同时也为企业提供稳定的资金来源。

具体到实际操作中，可能存在一些细节上的差异，需要根据具体的法规和政策进行调整。比如，有些公司可能会选择与特定的强积金服务提供商合作，以确保扣款的准确性和及时性。另外，如果公司员工有特殊需求或情况，如工资卡为非香港银行账户等，公司需要提前与强积金计划协调解决。

总之，香港公司强积金的扣款过程是一个涉及到多个方面和机构的复杂过程，需要公司、员工和相关机构之间的密切合作和沟通。只有这样才能确保扣款的准确性和及时性，保障员工的合法权益。

以上内容仅供参考，建议咨询专业律师获取更准确的信息。