在香港注册的公司是可以在内地经营的。

香港公司在内地经营需要办理一些必要的手续。比如要进行工商登记备案，根据内地相关法规，以香港公司名义在内地设立代表处等形式来开展经营活动。代表处可以从事一些与总公司业务相关的联络、咨询等非经营性活动。如果要开展经营性业务，则可能需要设立外资企业等形式，按照内地的外资企业设立流程进行审批和登记。

关于税收方面，香港公司在内地经营涉及的税收较为复杂。

企业所得税方面，如果香港公司通过在内地设立的机构、场所取得所得，且该机构、场所与取得的所得有实际联系，那么需要按照25%的税率缴纳企业所得税。但如果符合一定条件，比如该香港公司被认定为非居民企业，且其所得与境内机构、场所没有实际联系，或者是来源于中国境内的股息、红利等权益性投资收益和利息、租金、特许权使用费所得等，可以按照10%的税率缴纳企业所得税。

增值税方面，若香港公司在内地提供应税劳务、销售货物或者进口货物等，需要按照内地的增值税法规缴纳增值税。不同的业务类型适用不同的税率，如销售货物一般适用13%、9%等税率，提供应税劳务等也有相应规定。

还可能涉及印花税等其他税种。印花税是对经济活动和经济交往中订立、领受具有法律效力的凭证的行为所征收的一种税。香港公司在内地签订相关合同等应税凭证时，需要按照规定缴纳印花税。

对于税收的计算，是根据各项税收法规规定的计税依据和税率来确定。例如企业所得税是应纳税所得额乘以适用税率，应纳税所得额是收入总额减除不征税收入、免税收入、各项扣除以及允许弥补的以前年度亏损后的余额。增值税则是根据销售额和适用税率计算销项税额，然后减去进项税额来确定应纳税额。

香港公司在内地经营要充分了解并遵守内地的税收法规，准确计算和缴纳税款，避免税务风险。同时，在经营过程中可以通过合理的税务筹划，如利用税收优惠政策等方式，来降低税务成本，但必须确保筹划的合法性。香港公司在内地经营既要积极开展业务，也要规范税务处理，以保障企业的正常运营和持续发展。