香港是一个国际化水平很高的地域，吸引了众多企业前来注册。在香港注册的公司，需要每年进行审计，以确保其财务状态的真实性和精确性。但是，如果公司在第二年的审计中逾期，将会见临严重的后果。

首先，逾期审计会影响公司的信用度。在香港，公司的信用度非常关键，尤其是对于哪些想要在国际市场上拓展业务的公司来说。如果公司逾期审计，将会被视为不诚信的企业，这将会对公司的荣誉发生负面影响，从而影响公司的业务发展。

其次，逾期审计会导致公司面临罚款。依据香港公司条例，如果公司未能在规定的时间内完成审计，将会见临罚款。罚款的数额取决于逾期的时间长短和公司的范围。如果公司长期逾期审计，罚款数额将会非常高，这将会对公司的财务状态发生不利影响。

最后，逾期审计会导致公司被注销。如果公司长期逾期审计，将会被香港公司注册处注销。这将会导致公司失去注册资历，从而无法进行业务活动。如果公司想要重新注册，需要重新提交申请，并支付一定的费用。这将会给公司带来不必要的麻烦和经济累赘。

因此，对于在香港注册的公司来说，完成年度审计是非常关键的。如果公司无法按时完成审计，应当尽快与审计师联系，并尽快完成审计。只有这样，能力保证公司的信用度、避免罚款和注销的风险，从而保证公司的正常运营。

总之，香港公司第二年审计逾期的后果非常严重。公司应当看重年度审计工作，确保按时完成审计，以保证公司的正常运营和发展。